Фамилия Бакалюк образована по распространённой в украинской и белорусской ономастике модели с суффиксом -ук, который указывает на родство или принадлежность: «сын» или «потомок» человека по имени или прозвищу Бакал. Таким образом, центральный элемент фамилии — прозвище Бакал, и именно вокруг него строится поиск значения.

Самая прямая версия отсылает к белорусскому слову «бакала» — «ротозей». В таком случае прозвище могли дать человеку рассеянному, невнимательному либо, наоборот, излишне любопытному, который везде суёт нос. Это бытовая, «характерологическая» основа, типичная для народных прозвищ.

Другая, не менее правдоподобная гипотеза связывает прозвище с тюркским словом «бакала» в значении «бакалейный товар» — сухофрукты, копчёности, пряности. Тогда Бакал — это профессиональное прозвище торговца-бакалейщика. В пользу этой версии говорит то, что на южнорусских и украинских землях торговые контакты с тюркскими народами были обычным делом, и подобные заимствования в прозвищах встречаются часто.

Существует и более редкая, но любопытная версия — от киргизского «бакал» («солома»). Если принять её, то прозвище могли дать крестьянину, который заготавливал солому или плёл из неё шляпы и циновки. Однако географическая привязка к Средней Азии делает эту гипотезу менее вероятной для фамилии, распространённой в западнорусских и украинских землях.

Иногда пытаются связать фамилию с топонимом Бакал — городом в Челябинской области. Название города выводят либо из башкирского «бакал аркассе» («гряда гор»), либо от слова «бакал» — «лягушка» (болотистое место). Однако маловероятно, чтобы носитель фамилии Бакалюк вёл свой род из уральского города, основанного лишь в XVIII веке: модель фамилий на -ук формировалась в основном в XV–XVII веках на территории современной Украины и Беларуси. Версия с топонимом выглядит натянутой, хотя полностью исключать её нельзя — переселенцы могли получить прозвище по месту выхода.

Из всех вариантов наиболее обоснованными выглядят две версии: либо прозвище Бакал отражало черту характера («ротозей»), либо указывало на профессию предка (торговец бакалеей). В любом случае, фамилия Бакалюк — это типичное патронимическое прозвище, которое перешло в фамилию и закрепилось за потомками.