Фамилия Бакатура не входит в число распространённых, и её носителей чаще встретишь на юге России и в восточных областях Украины. В основе фамилии лежит прозвище, а не крестильное имя, и ключ к её разгадке — украинское или южнорусское слово «бакатура». В говорах так называли человека упрямого, своенравного или, напротив, нерасторопного, «тяжелого на подъем». Слово это, скорее всего, тюркского происхождения, родственное турецкому «bakatur» — «храбрый, удалой», но в славянской среде значение сместилось в сторону ироничного или неодобрительного: не столько «богатырь», сколько «упрямец».

Модель образования фамилии — бессуффиксная, что для восточнославянских фамилий редкость. Обычно фамилии образуют с помощью суффиксов -ов, -ин, -ский, но здесь прозвище Бакатура перешло в фамилию без изменений, как есть. Такое часто случалось в казачьей среде и среди крестьян, где прозвище могло закрепиться за родом без дополнительных формальностей. Сравните с однокоренными, но суффиксальными фамилиями — Бакатуров, Бакатуренко — они встречаются чаще и говорят о том же корне, но с разной географией: первая типична для России, вторая — для Украины.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с профессией. В некоторых диалектах «бакатура» — это вид корзины или кузова, а значит, прозвище мог получить корзинщик или торговец, носивший товар в такой таре. Но эта гипотеза слабее, потому что слово «бакатура» в значении «корзина» почти не фиксируется словарями, а вот в значении «упрямец» — вполне.

Фамилия недворянская, не встречается среди столбового дворянства. Её носители — люди из крестьянской или мещанской среды, чаще всего из чернозёмных губерний. В дореволюционных метрических книгах Бакатура встречается в Харьковской, Екатеринославской и Воронежской губерниях. Сегодня фамилия остаётся редкой, но сохраняет колорит южнорусского говора и напоминает о прозвищах, которые давали по характеру, а не по ремеслу.