Фамилия Бакатуев, вероятнее всего, восходит к названию города Бакатуй, расположенного в Иркутской области России. Можно предположить, что предок основателя данной фамилии был уроженцем или жителем этого города. Также возможно, что прозвище Бакатуй происходит от украинского слова «бакатина», которое переводится как «бакен», т.е. «поплавок на якоре (ночью со светом), который устанавливается на реках, озерах и т.п. для обозначения фарватера и опасных мест». Согласно этому, можно предположить, что основатель рода Бакатуевых был моряком. Менее вероятно, что в основе этого прозвища лежит диалектное нарицательное «бокат», которое в старину означало «бок», «бочка». В этом случае, прозвище Бакатуй мог получить полный человек или бочар, мастер по изготовлению бочек. Чередование о/а объяснятся историческими изменениями в языке.