Фамилия Бокатуев — редкий случай, когда основу, скорее всего, нужно искать не в славянских, а в тюркских языках. По своей модели это типичная русская фамилия на -ев, но корень «Бокату» почти наверняка восходит к тюркскому прозвищу или имени. Самая вероятная версия — от слова «багатур» (богатырь, храбрец, воин). В разных тюркских диалектах это слово звучало как «батыр», «батур», «богатур». Форма «Бокатуй» могла возникнуть в результате местного произношения или адаптации в русской среде: звук «а» перешёл в «о» под влиянием акающих говоров, а конечное «-й» — типичный тюркский суффикс, образующий имена.

То есть прозвище Бокатуй давали сильному, отважному человеку, возможно, воину или тому, кто отличался физической мощью. В русских документах XVI–XVII веков нередко встречаются татарские или башкирские имена и прозвища, которые затем становились фамилиями у служилых людей, казаков или крестьян. Бокатуевы могли быть выходцами из татарской или башкирской среды, принявшими православие, либо русскими, получившими такое прозвище за сходство с тюркским богатырём.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «бокатый» (толстый, пузатый, с большим боком). Однако в этом случае фамилия скорее выглядела бы как Бокатов или Бокатый, а суффикс -уев нехарактерен для такой основы. Поэтому тюркское происхождение остаётся главным.

Географически фамилия встречается в Поволжье и на Урале — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях, что подтверждает её связь с тюркскими народами этих регионов. Сословно носители, скорее всего, были либо казаками, либо государственными крестьянами — точных данных о дворянском происхождении нет. Фамилия нечастотная, что делает её особенно ценной для семейной истории: круг предков узок, и при желании можно проследить род до XVII–XVIII веков по местным архивам.