Фамилия Баххчалов — редкий случай в русской ономастике, где написание сразу бросается в глаза. Двойное «хх» в корне нехарактерно для исконно русских фамилий, образованных от славянских основ. Такое удвоение почти всегда указывает на иноязычное происхождение — скорее всего, тюркское или кавказское. Вероятнее всего, в основе лежит имя или прозвище Баххча, которое могло быть вариантом тюркского имени Бахча (от слова «бахча» — сад, огород) или восходить к арабскому корню, связанному с понятиями «счастье», «удача» (ср. Бахтияр). Удвоение «хх» могло возникнуть на русской почве при передаче звучания, где в языке-источнике был гортанный или фарингальный звук, который русские писцы записали как два «х».

Суффикс -ов указывает на стандартную русскую модель образования фамилий от отчества или прозвища: «сын Баххчи». Формально фамилия вписывается в патронимический тип, распространённый у всех сословий после отмены крепостного права. Однако двойное «х» делает её неудобной для произношения, поэтому в быту, скорее всего, она могла упрощаться до Бахчалов.

Географически фамилия тяготеет к регионам с сильным тюркским или кавказским влиянием — Поволжье, Северный Кавказ, Закавказье. Встречается она редко, и это может говорить о том, что родоначальник был выходцем из мест, где такие имена были распространены, а в русскоязычной среде фамилия закрепилась в документах, но не дала массового потомства. Если сравнивать с однокоренными — Бахтин, Бахтеев, Бахчаев — то Баххчалов стоит особняком из-за своей графической громоздкости, что делает её скорее «кабинетной» записью, чем естественно сложившейся формой.

Никаких сведений о дворянском происхождении или принадлежности к известным родам по этой фамилии нет. Это, скорее всего, поздняя фамилия, образованная от прозвища, которое дали человеку, имевшему отношение к бахче (огороду), либо носившему восточное имя. В любом случае, в основе лежит слово, связанное с земледелием или личным именем, а двойное «х» — след фонетической адаптации чужого звука.