Фамилия Бахотский — редкий пример, где географическое прозвище почти наверняка перевесило личное имя или профессию. Суффикс -ский в русской традиции чаще всего указывает на связь с местностью: владельческой (помещичьей) или административной. В отличие от «крестьянских» суффиксов -ов/-ев, фамилии на -ский в XVII–XIX веках закреплялись за дворянством, духовенством и выходцами из западных земель (Польша, Украина, Беларусь). Бахотский, скорее всего, образован от названия населённого пункта вроде Бахоты, Бахотки или Бахотино.

Корень «бахот» неочевиден. Самая правдоподобная версия — диалектное или топонимическое слово, связанное с «бах» (звук падения, удара, хлопка) или «бахать» (громко говорить, падать). В псковских и тверских говорах «бахотня» означала шум, возню. Если село или хутор называли Бахоты из-за шумного ручья или ветреного места, то прозвище жителя — «бахотский» — быстро перешло в фамилию. Менее вероятна связь с личным именем Бахот (редкая форма от Богдан или Вахрамей) — для таких случаев характерен суффикс -ов, а не -ский.

В польской ономастике фамилия Báchocki могла возникнуть от названия урочища Báchoty (от bach — «мальчик, парень» в старопольском). Это объясняет, почему фамилия встречается не только в центральной России, но и в западнорусских губерниях. По данным переписей XIX века, Бахотские фиксировались в Витебской и Смоленской губерниях — как раз на стыке русских и польских земель, где топонимы на -ский были нормой для шляхты и мещан.

Социальный статус носителей фамилии, вероятнее всего, — мелкопоместное дворянство или духовенство. В синодальных ведомостях XVIII века упоминаются священники Бахотские в сельских приходах Могилёвской епархии. Дворянский род Бахотских, если он существовал, не был внесён в губернские родословные книги — фамилия осталась локальной, не получив общероссийской известности.

Сегодня фамилия встречается редко, преимущественно в Беларуси и западных областях России. Её носители, скорее всего, потомки тех, кто когда-то жил в деревне, названной по звуку или шуму — и эта бытовая деталь закрепилась в фамилии на века.