Фамилия Баховка звучит необычно для русского уха — это подсказка, что перед нами не столько фамилия в привычном виде, сколько прозвище, застывшее в форме существительного. В русской ономастике фамилии на -ка, -овка, -инка чаще всего имеют украинское или белорусское происхождение. Баховка — яркий тому пример. Основа здесь — «бах», слово с богатой историей. В южнорусских и украинских говорах «бах» означало и звук удара, выстрела («бах!»), и самого задиру, хвастуна или драчуна. Человек, любивший громко говорить, хвастаться или, наоборот, вспыльчивый, мог получить прозвище Бах, а его потомки — фамилию Баховка, то есть «сын Баха» или «родня Баха». Суффикс -овка в украинской традиции часто указывал на принадлежность к роду или местности, но здесь он скорее превращает прозвище в фамилию-прозвание, как, например, Коваль — Ковалёв.

Менее вероятная, но возможная версия — топонимическая. В некоторых регионах, особенно на западе Украины и в Беларуси, «баховка» могла быть названием небольшого хутора или усадьбы, образованным от фамилии владельца Бах или от местного слова «бах» (например, «бахча» — огород, бахчевая культура). Тогда фамилия могла возникнуть у человека, который переехал из такого места: «Иван из Баховки». Однако в словарях и исторических документах топоним Баховка встречается редко, поэтому прозвищное происхождение выглядит убедительнее.

В отличие от распространённых фамилий на -ов, Баховка сохранила свою первоначальную форму без изменений — это так называемая «украинская» модель фамилии, которая не перешла в стандартное русское склонение. В документах XIX века такую фамилию могли записать и как Бахов, Баховский, но закрепился именно вариант с суффиксом -ка, что говорит о сильном влиянии местного говора и устной традиции. Носители фамилии Баховка, скорее всего, происходят из среды крестьян или казаков — в этих сословиях прозвища, данные по характеру или поведению, передавались из поколения в поколение без изменений. Сословных привилегий фамилия не даёт, зато сохраняет живую, почти звукоподражательную энергию — «бах» слышится в ней до сих пор.