Фамилия Бакутеев образована от имени Бакутей, простонародной формы крестильного мужского имени Аввакум (в разговорном варианте - Абакум). Оно имеет древнееврейское происхождение и переводится на русский язык как «обнимающий». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Бакутей, со временем получил фамилию Бакутеев.