Фамилия Балденковы — отчество в третьем поколении. Её основа — прозвище Балда, а сама фамилия построена по цепочке: Балда → Балденко (сын Балды) → Балденков (внук Балды). Суффикс -енко в промежуточной форме указывает на украинское или белорусское влияние: такие модели отчеств были типичны для юго-западных земель, а затем, при смещении на север, обрастали русским суффиксом -ов.

Значение прозвища Балда неоднозначно, и тут стоит разобраться подробнее. Первая версия — профессиональная. Нарицательное «балда» означало тяжёлый молот для горных работ или кузницы, а также деревянную колотушку. Человек, получивший такое прозвище, мог быть кузнецом, молотобойцем или плотником — мастером, чья работа требовала увесистого инструмента. Вторая версия — диалектная и описательная. В вологодских говорах «балда» — долговязый и неуклюжий человек, в рязанских — сплетник или баламут, в костромских — бестолковый. Прозвище могло закрепиться за внешностью или характером предка.

Одно из ранних упоминаний прозвища относится к 1564 году: в документах записан крестьянин Балда Кондрат из Одонца. Это не значит, что все Балденковы — его прямые потомки, но показывает, что прозвище бытовало в среде крестьянства ещё в XVI веке. Фамилия, скорее всего, оформилась позже, когда отчества стали передаваться по наследству и застывать в родовом имени. Форма Балденков — результат долгого пути: от прозвища к отчеству на -енко, а затем к фамилии на -ов, что типично для фамилий, возникших на стыке украинской и русской традиций.