Фамилия Баллос — редкий случай, когда корень слова не даёт однозначной подсказки, а сама фамилия звучит одинаково естественно и по-русски, и по-еврейски, и по-гречески. Начнём с самого простого: если отбросить типичный русский суффикс -ов, получится основа Балл. Но окончание -ос фамилии Баллос указывает на то, что перед нами не типичная русская модель с суффиксом, а скорее готовая основа греческого происхождения. В греческом языке «баллос» (βάλλος) означает «пёстрый», «рябой». Такое прозвище могли дать человеку с необычной внешностью — веснушками, сединой в бороде или просто пёстрой одеждой. В русской среде фамилия могла закрепиться за выходцами из греческих поселений Причерноморья или за священниками, учившимися в греческих семинариях.

Есть и вторая версия, не менее правдоподобная. Фамилия Баллос могла возникнуть в еврейской среде, как вариант фамилии Баллас или Баллес. В этом случае корень восходит к еврейскому слову «баллас» (בַּלָּס) — «сборщик налогов» или, в более широком смысле, «откупщик». Эта профессия была распространена среди еврейских общин Восточной Европы, где многие занимались арендой и сбором податей. Фамилия могла попасть в русские документы через черту оседлости, а написание с двойной «с» и ударением на второй слог — результат канцелярской записи.

Третья, самая простая гипотеза — что фамилия произошла от прозвища Балда, а суффикс -ос приставлен уже в XIX веке по моде на «благородные» окончания. Однако это маловероятно: фамилии с таким окончанием в русской среде почти не встречаются, а если бы они и были, то писались бы как Балдов или Балдин.

Географически фамилия Баллос встречается в основном на юге России и Украины, а также среди потомков греческих переселенцев в Приазовье. Встречается она и у еврейских семей из Бессарабии и Подолья. Однозначно сказать, какая из версий верна для конкретного носителя, можно только по архивным документам: метрическим книгам, ревизским сказкам. Но если выбирать самую частую и логичную — это греческое прозвище «пёстрый».