Фамилия Бальсунов — редкий случай в русской ономастике, где очевидная на слух основа не даёт однозначной расшифровки. Привычный суффикс -ов указывает на отчество или принадлежность: Бальсунов — сын Бальсуна. Но вот само прозвище Бальсун (или Бальсун) вызывает споры.

Самая вероятная версия связывает фамилию с диалектным словом «бальсун» — так в некоторых южнорусских и украинских говорах называли болтуна, пустомелю. Слово образовано от глагола «балакать» (говорить) с экспрессивным суффиксом -ун (как «говорун», «крикун»). Переход «бала» в «баль» — не редкость в живой речи: чередование гласных и упрощение дали форму «бальсун». Если это так, то первый носитель фамилии получил прозвище за словоохотливость или привычку рассказывать небылицы.

Менее распространённая гипотеза выводит основу из тюркских языков. В тюркских наречиях встречается корень «балыс» или «балсун» со значением «медовый», «сладкий». Такое прозвище могли дать человеку с мягким, уступчивым характером или, напротив, льстецу. Однако эта версия слабее: во-первых, типично тюркские фамилии в России чаще образуются через -ин (Бальсунин), а во-вторых, слово «бальсун» не фиксируется в известных тюркских словарях как личное имя или устойчивое прозвище.

Географически фамилия тяготеет к югу России: единичные записи встречаются в документах Воронежской и Ростовской областей, а также в Краснодарском крае. Это косвенно подтверждает диалектную версию — именно в этих регионах бытовало слово «бальсун» как синоним болтуна.

В написании фамилии возможна вариативность: изредка встречается форма Бальсунов с мягким знаком на конце основы (Бальсуньов), но это скорее результат ошибки переписчика, чем самостоятельная ветвь. Современные носители фамилии — люди разных профессий, и никакой сословной привязки у Бальсуновых не прослеживается: прозвище могло закрепиться и за крестьянином, и за мещанином.