Фамилия Банайтис, по одной из версий, восходит к слову «банайте», что в переводе с идиш означает «обновленный». Возможно, основатель рода Банайтис был евреем. Согласно другой гипотезе, фамилия Банайтис образована от топонима Банат — историческая область в юго-восточной Европе, в междуречье Муреша, Тисы и Дуная, на востоке ограниченном Трансильванскими Альпами. она принадлежала Венгрии, с середины 16 в. до начала 18 в. находилась в составе Австрии. В результате колонизации в 18-19 вв. в Банате сложился пёстрый этнический состав населения (румыны, сербы, хорваты, венгры, словаки, немцы и др.). большая часть Баната вошла в состав Румынии, остальная - в состав Югославии. Возможно, родоначальник Банайтис жил в этой области.