Фамилия Бардушко — редкий случай, когда географический и языковой следы почти не расходятся. В основе лежит имя Бардо, которое может быть как полной формой крестильного имени Варфоломей (в просторечии Барфоломей, с утратой «в» и упрощением), так и самостоятельным прозвищем. Суффикс -ушко в украинской и белорусской ономастике — уменьшительно-ласкательный, характерный для фамилий западных и южных регионов (сравните: Гришко, Данько, Петрушко). Таким образом, Бардушко — это «маленький Бардо» или «сын Бардо», то есть патроним, образованный от личного имени или прозвища отца.

Вторая версия, менее вероятная, но не исключённая: связь с диалектным «барда» — густая мутная жидкость, отходы винокурения, или с «бардой» — кормом для скота. Прозвище Барда могли дать человеку, занимавшемуся самогоноварением или державшему скотину на барде. Однако суффикс -ушко в этом случае придавал бы слову пренебрежительный оттенок («бардов сынок»), что для устойчивой фамилии нетипично. Ономастический словарь Б. Унбегауна фиксирует схему образования фамилий на -ушко как продуктивную именно для личных имён, а не для нарицательных прозвищ, поэтому версия с Варфоломеем выглядит предпочтительнее.

Географически фамилия Бардушко тяготеет к западу Украины и югу Беларуси. Встречается в Волынской, Ровенской, Брестской областях, реже — в Польше на Подляшье. В России почти не зафиксирована, что подтверждает её региональную привязку к зоне украинско-белорусского пограничья. Социальный контекст: такие фамилии обычно носили крестьяне или мещане, не принадлежавшие к шляхте (у которой преобладали фамилии на -ский). В документах XVII–XVIII веков подобные формы встречаются в реестрах казаков и селян.

Написание фамилии устойчивое: через «у» после «д», без вариантов «Бардошко» или «Бардушка». Ударение, скорее всего, на последний слог — Бардушко́, по аналогии с другими украинскими фамилиями на -ко, хотя в русской среде возможно смещение на первый слог.