Фамилия Башарин — один из примеров, когда русская по форме фамилия хранит в основе тюркское или арабское имя. Её ядро — личное имя Башар, которое пришло из арабского языка и означает «человек» или «люди». Это имя было распространено у народов, исповедующих ислам, и попало в русскую среду через выходцев из Золотой Орды, а также через печенегов и половцев, осевших на русских землях.

Фамилию образовали по стандартной русской модели: к основе Башар добавили патронимический суффикс -ин, который отвечает на вопрос «чей?» и указывает на принадлежность к отцу. То есть Башарин буквально означал «сын Башара» или «потомок Башара». Такая модель типична для фамилий, возникших в XV–XVII веках, когда в России активно шёл процесс оформления родовых прозваний.

Восточное происхождение фамилии Башарин не редкость для русского дворянства. В те века многие служилые люди нерусского происхождения вливались в состав московской аристократии, и их имена становились основами для фамилий. Поэтому Башарины, скорее всего, вели свой род от татарского или другого тюркского мурзы, перешедшего на русскую службу.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Башарин стоит в одном ряду с Башаровым (где суффикс -ов указывает на ту же основу) или более редкими формами вроде Башаринова. Но именно форма на -ин закрепилась за этим родом, что может говорить о более раннем или более тесном вхождении носителей в русскую языковую среду.