Фамилия Башкирский — редкий случай, когда этноним (название народа) стал фамилией напрямую. Чаще всего такие фамилии, как Татаринов, Калмыков или Мордвинов, образовывались с помощью суффикса -ов/-ев, указывая на происхождение от предка-инородца. Здесь же мы видим модель с суффиксом -ский, что сразу меняет историю.

Суффикс -ский в русских фамилиях чаще всего указывает на территориальную или географическую привязку: владелец земли, переселенец из определённого места или, реже, принадлежность к сословию (дворянские фамилии нередко оканчивались на -ский). В случае с «Башкирским» логичнее всего предположить, что фамилию дали не по национальности, а по месту жительства или службы. Предок мог быть выходцем из Башкирии или из населённого пункта с названием вроде Башкирка, Башкирское. Такие деревни встречаются в Оренбургской, Челябинской областях и в самом Башкортостане.

Версия о прямом происхождении от этнонима «башкир» маловероятна по двум причинам. Во-первых, в России было принято давать фамилии на -ов/-ев по отцу-инородцу (например, Башкиров), а на -ский — по земле или статусу. Во-вторых, если бы предок был самим башкиром, его бы скорее записали как Башкиров или оставили без фамилии вовсе, а не давали ему «княжеское» окончание -ский.

Интересно, что фамилия почти не встречается в исторических документах до XX века. Это говорит о том, что она могла быть поздней, искусственной — например, её могли дать в духовных училищах или при переписи населения в советское время, когда крестьянам массово придумывали фамилии. В таком случае «Башкирский» могло означать просто «уроженец Башкирии» без глубокой родовой истории.

Сравнение с однокоренными фамилиями подтверждает редкость формы. Башкиров встречается в десятки раз чаще, а Башкирцев — ещё реже, чем Башкирский. Таким образом, носитель фамилии Башкирский, скорее всего, ведёт род из мест, где компактно жили башкиры или русские переселенцы в Башкирию, а сама фамилия — не национальный маркер, а географическая метка, закрепившаяся за конкретной семьёй.