Фамилия Батуев образована от прозвища Батуй из украинского глагола «батувати» - «резать крупными кусками». Скорее всего, так называли жадного или, напротив, щедрого человека. Однако нельзя исключить, что прозвище связано с родом занятий предка: он мог быть мясником. Согласно другой, менее правдоподобной версии, в основе этой фамилии лежит киргизское имя Батый, арабский аналог которого – Фатим («победитель»). Одним из самых известных представителей фамилии являются Николай Александрович Батуев, профессор анатомии и Александр Сергеевич Батуев, российский психофизиолог, специалист в области общей и возрастной физиологии мозга и теории антропогенеза. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Батуй, со временем получил фамилию Батуев.