Фамилия Баякынов — редкий пример, где расшифровка лежит не в славянской, а в тюркской ономастике. Это фамилия с ярко выраженным географическим и этническим «адресом»: она почти наверняка происходит из киргизской или казахской среды. Основа — личное имя или прозвище Баякын, которое, в свою очередь, распадается на два корня: «бай» (богатый, состоятельный, уважаемый) и «акын» (поэт-импровизатор, певец). В переводе с киргизского и казахского Баякын означает «богатый акын» или «состоятельный певец». Это не простое именование, а, скорее всего, почётное прозвище, которое давали народному сказителю, снискавшему уважение и достаток своим искусством.

Суффикс -ов в этой фамилии — показатель русификации, типичный для многих нерусских фамилий, которые фиксировали в документах Российской империи и СССР. Исходная форма, вероятно, звучала как Баякынов, где суффикс -ов добавлялся к основе Баякын по аналогии с русскими отчествами. Без этого суффикса фамилия осталась бы в виде Баякын, но в русскоязычной среде прижился именно «овский» вариант.

Интересно, что в отличие от многих фамилий с корнем «бай», которые указывают на богатство или знатность рода, Баякынов отсылает к конкретному занятию. Акыны в степной культуре — не просто поэты, а хранители истории, импровизаторы, участники айтышей (поэтических состязаний). Прозвище Баякын могло закрепиться за человеком, который не только слагал стихи, но и добился в этом деле успеха и материального благополучия, что для кочевого общества было редкостью и уважалось особо.

С точки зрения словообразовательной модели, фамилия редкая. Сочетание «бай + акын» встречается нечасто, и в русском ономастиконе она стоит особняком. Встречаются однокоренные варианты — Баякынов, Баякынов, но все они восходят к тому же имени-прозвищу. Географически фамилия тяготеет к северу Киргизии и югу Казахстана, где традиция акынства была особенно сильна. В документах XIX века такая фамилия могла появиться у представителей знатных родов, которые приняли русское подданство, или у оседлых скотоводов, чьё имя записали при переписи.