Фамилия Байгильдин происходит от личного мужского имени Байгильде. Это составное имя восточного происхождения, и его смысл складывается из двух частей. Первая часть — «бай» — восходит к древнеарабскому слову со значением «хозяин, богатый, могущественный господин». В современном языке этот корень по-прежнему ассоциируется с богатством и изобилием. Вторая часть — «гильде» — тюркская, переводится как «пришёл, родился». Таким образом, имя Байгильде в целом означает «пришёл (родился) бай (хозяин)».

Словообразовательная модель фамилии проста: к тюркскому имени добавили русский патронимический суффикс -ин, который указывает на принадлежность («чей?» — сын Байгильды). Такая модель типична для фамилий, возникших в среде крещёных татар, башкир и других тюркских народов Поволжья и Урала, где имена с компонентом «бай» были особенно распространены.

Сам факт появления этой фамилии в русском контексте связан с историческими процессами XV–XVII веков. В ту эпоху многие представители тюркской знати и служилых людей переходили на службу к русским князьям и царям, принимали православие и получали земли. Их потомки, влившись в состав русского дворянства, оформляли свои родовые прозвания по русскому образцу. Однако не стоит думать, что все Байгильдины — непременно дворяне. Фамилия могла закрепиться и за крестьянами или посадскими людьми, которые носили имя Байгильде.

Интересно, что в некоторых говорах и документах встречается вариант написания «Байгильдины» — во множественном числе, что подчёркивает родовую принадлежность (весь род Байгильдиных). В современном русском языке закрепилась форма единственного числа с ударением, скорее всего, на последнем слоге: Байгильди́н.

Точное место возникновения конкретной ветви Байгильдиных можно установить только через генеалогические разыскания — например, по ревизским сказкам или метрическим книгам Оренбургской, Уфимской или Казанской губерний, где такие фамилии встречаются чаще всего.