Фамилия Байконысова — яркий пример казахской антропонимики, русифицированной через суффикс -ов/-ев. Её основа — мужское имя Байконыс, которое в свою очередь сложено из двух тюркских компонентов: «бай» (богатый, могущественный, господин) и «коныс» (поселение, жильё, ночлег). Буквально имя переводится как «богатое поселение» или «обильное жильё». В казахской среде такие имена нередко давали с пожеланием достатка и благополучной жизни в доме.

Суффикс -ова указывает, что перед нами женская форма фамилии. Мужской вариант — Байконысов. Окончание -ов (а не -ев) говорит о том, что основа заканчивается на твёрдый согласный. По модели образования это типичная русская патронимическая фамилия, закреплённая за казахским родом в период имперского делопроизводства, когда фамилии записывали по отцу с добавлением русского суффикса.

Сложность анализа — в том, что казахское имя Байконыс встречается не повсеместно, а преимущественно в южных и центральных регионах Казахстана, где традиция составных имён с элементом «бай» была особенно распространена. В ономастических справочниках (например, у Т. Жанузакова) имя Байконыс фиксируется как редкое, но не уникальное. Родственные фамилии — Байконыров, Байконысов — встречаются у казахов, а также у татар и башкир, что говорит о широком тюркском ареале.

Сословная принадлежность носителей фамилии в XIX веке, скорее всего, была крестьянской или скотоводческой — основная масса казахского населения относилась к «простому» сословию. Дворянских корней у фамилии нет, если не считать редких случаев, когда баи (богатые скотоводы) могли получить личное почётное звание, но это не меняло общей картины.

Интересная деталь: в русском написании фамилия Байконысова иногда путается с топонимом Байконур (космодром), но это разные слова. «Байконур» — «богатый бурый» (от «нур» — свет, луч), а «Байконыс» — «богатое жильё». Смысловая разница существенная, хотя корень «бай» общий.