Фамилия Баймагабетов — редкий случай, когда о происхождении можно говорить почти уверенно, не гадая на кофейной гуще. Она тюркская, казахская по корням, и её основа — составное личное имя Баймагабет.

Разложим имя на части. «Бай» в тюркских языках — богатый, могущественный, господин. В именах этот компонент часто был пожеланием достатка и высокого положения. «Магабет» — это искажённое на слух арабское «Махаббат», что значит «любовь». В казахской ономастике имя Махаббат (и его варианты вроде Магабет) встречается, хотя и не так часто, как, скажем, Айгуль. Соединившись, «Бай» и «Магабет» дают имя-пожелание: «богатая любовь» или «богатство любви».

Русский суффикс -ов, добавленный к основе, — стандартный способ русификации тюркских фамилий в XIX–XX веках. Он не меняет смысла, а лишь оформляет фамилию по русской грамматической модели, отвечая на вопрос «чей?» — сын Баймагабета. Ударение в фамилии, скорее всего, падает на третий слог: Баймагабе́тов, хотя в быту возможны варианты.

Географически фамилия почти наверняка привязана к Казахстану и приграничным с ним регионам России — Астраханской, Оренбургской, Омской областям. Носители её — потомки казахов, чьи предки приняли русское подданство и чьи имена были записаны в метрические книги с добавлением фамильного суффикса. Дворянского сословия за этой фамилией не числится: это народная, крестьянская или, точнее, скотоводческая фамилия, распространённая в среде простых кочевников и земледельцев.

Встречается искажённое написание — Баймагомедов. Это типичная ошибка, когда на слух тюркское «Магабет» заменяют привычным кавказским «Магомед». Но исходная форма именно через «б» и «т»: Баймагабетов. Если ищете предков, стоит учитывать оба варианта в архивах, но верный — первый.