Фамилия Баимаганбетов — редкий пример тюркской антропонимии, которая перешла в русскую фамильную модель через суффикс -ов, но сохранила внутреннюю структуру, свойственную казахским и башкирским именам. Её основа — сложносоставное личное имя Баимаганбет, которое распадается на три части: бай (богатый, хозяин, уважаемый человек), маган (вариант слова «мне» или «для меня» в тюркских языках) и бет (лицо, лик, судьба, доля). В буквальном прочтении имя могло означать «судьба, благосклонная ко мне» или «богатая мне доля».

Модель образования фамилии — типичная для XIX–XX веков, когда русская администрация фиксировала имена инородцев в документах, прибавляя к ним патронимический суффикс -ов. В среде казахов и башкир фамилии на -ов часто получали от имени отца или деда, поэтому Баимаганбетов буквально значит «потомок Баимаганбета». Интересно, что суффикс -ов здесь не родовой, а скорее формально-канцелярский: в тюркской среде такая модель прижилась, вытеснив более древние способы образования отчеств.

Географически фамилия тяготеет к западному Казахстану и прилегающим областям России. Встречается в Актюбинской, Западно-Казахстанской областях, а также среди башкир Оренбуржья. Связано это с тем, что имя Баимаганбет — не случайное, а составное из распространённых компонентов: бай и бет входят в десятки казахских имён (Байбет, Бекбет, Маганбет). В казахской ономастике такие имена нередко давали с пожеланием удачи или как оберег, подчёркивающий особую роль человека в семье.

С точки зрения социального контекста, носители фамилии в дореволюционный период относились к кочевому или полукочевому скотоводческому населению. В отличие от фамилий на -ский или -ин, которые часто указывали на дворянство или духовенство, Баимаганбетов — фамилия крестьянская, точнее, скотоводческая, без привязки к сословию. В советское время она распространилась с урбанизацией казахов и башкир, но до сих пор сохраняет заметную региональную концентрацию.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями (Маганбетов, Баймаганбетов, Бекмаганбетов), то Баимаганбетов — одна из самых коротких форм: в ней нет лишнего компонента вроде бек или батыр, что делает её более архаичной. Полных тёзок у фамилии мало, а в метрических книгах XIX века она почти не встречается — это говорит о том, что фамилия оформилась поздно, уже в XX веке, когда началась массовая паспортизация.