Фамилия Байтуганти — редкий вариант, родственный более известной фамилии Байтуганов. Обе они образованы от тюркского составного имени Байтуган, где первая часть «бай» означает «богач, зажиточный человек», а вторая — «туган» — имеет два значения: «родственник, родной» (от глагола «родиться») и «сокол». В тюркских языках Кавказа и Средней Азии слово «туган» соединяет обе эти смысловые линии, поэтому имя Байтуган могло означать как «богатый родственник», так и «богатый сокол» — прозвище, данное человеку за сходство с гордой и зоркой птицей.

Различие фамилий Байтуганов и Байтуганти кроется в суффиксе. Первая образована по русской модели с суффиксом -ов (чей? — сын Байтугана). Вторая же — Байтуганти — сохраняет тюркский суффикс -ти, характерный для некоторых языков Кавказа и Поволжья. Этот суффикс указывал на принадлежность к роду или месту: буквально «из рода Байтугана» или «из селения Байтуган». Такие фамилии редко встречаются в официальных документах Российской империи, так как при переписях тюркские окончания часто заменяли на русские -ов/-ев. Поэтому Байтуганти — более архаичная форма, которая могла закрепиться в семьях, долго живших в изолированных аулах или не проходивших массовую русификацию фамилий.

Географически фамилия Байтуганти тяготеет к районам компактного проживания тюркских народов — татар, башкир, кумыков или ногайцев. Встречается она редко, и её носители — потомки людей, носивших личное имя Байтуган. В дореволюционное время такое имя давали мальчикам в семьях, где ценили достаток и родовые связи, а иногда — как пожелание удачи в охоте (если вспомнить значение «сокол»). Сословно это были, скорее всего, крестьяне или мелкие торговцы, так как знатные тюркские роды чаще оформляли фамилии через княжеский суффикс -ский или -беков.

Особенность написания — конечное -ти — нередко путают с грузинскими фамилиями (на -ия, -дзе), но здесь это чисто тюркский показатель. В старых метрических книгах фамилию могли записывать как Байтуганты, Байтуганди или даже Байтуганов, если писарь переделывал её на русский лад. Современное написание Байтуганти — результат фиксации исходной формы в паспортах советского времени, когда перестали «русифицировать» фамилии по желанию носителей.