Фамилия Бедерин — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не профессия, а, скорее всего, диалектное прозвище. Сразу бросается в глаза суффикс -ин, характерный для фамилий, образованных от слов женского рода или от прозвищ на -а/-я: Бедера, Бедера. Именно от такой формы и пошла фамилия. В русских говорах слово «бедера» или «бедеря» имело два основных значения: либо неряшливый, неопрятный человек, либо, наоборот, бойкий, вертлявый, непоседливый (от глагола «бедерить» — суетиться, егозить). Оба значения — прозвищные, и какое из них закрепилось за конкретным предком, сказать сложно: прозвище могло даваться как за внешний вид, так и за характер.

Поскольку фамилия не включает типичных дворянских суффиксов (-ский, -ов) и не встречается в родословных книгах знати, её носители, скорее всего, происходили из крестьянской или мещанской среды. Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России, особенно к Вологодчине и Архангельской губернии, где диалектное слово «бедера» было в ходу. Встречается она и в Приуралье, куда переселенцы принесли её с собой в XVII–XVIII веках.

Редкость фамилии объясняется просто: прозвище Бедера было нечастым, а после отмены крепостного права его закрепили в документах лишь отдельные семьи. В отличие от массовых фамилий вроде Иванов или Кузнецов, Бедерин — штучный товар ономастики. Если искать однокоренные параллели, то стоит вспомнить фамилию Бедеров — она образована по той же модели, но с другим суффиксом, и встречается ещё реже. Встречается вариант написания с одной «д» — Берин, но это уже совсем другая история, связанная с именем Бер (медведь) или рекой Берёзой.