Фамилия Бекдаиров образована от сложного восточного имени Бекдаир. Первая часть имени восходит к древнетюркскому слову «бек» — «князь, повелитель, господин». Вторая часть связана с мусульманским именем Даир, которое, по одной из версий, восходит к казахскому «дауір» — «эпоха, время, период». Составное имя Бекдаир можно толковать как «властелин времени» или «князь эпохи». Родители, давая такое имя, желали сыну долгой и счастливой жизни, а также высокого положения и уважения в обществе.

Фамилия образована по русской модели с патронимическим суффиксом -ов, который в данном случае означает «сын Бекдаира». Это типичный способ русификации тюркских имен: основа имени Бекдаир плюс фамильный суффикс. Такие фамилии чаще всего встречаются у народов Северного Кавказа, татар и казахов, где имя Бекдаир (или его варианты) было распространено, а затем закрепилось в русской документации именно в такой форме.

Стоит отметить, что второй компонент имени — Даир — может иметь и другие корни. В арабском языке есть имя Даир, означающее «круг» или «окружность», что символизирует цикличность жизни. Однако версия с казахским «дауір» выглядит более правдоподобной для фамилии, бытующей в среде тюркоязычных народов. В любом случае, обе трактовки сходятся в том, что имя Бекдаир должно было принести своему носителю власть и удачу во времени.

Географически фамилия Бекдаиров в основном привязана к регионам расселения казахов, а также к Дагестану и другим областям Северного Кавказа. Встречается она нечасто, что говорит о её относительно локальном происхождении. Потомок человека по имени Бекдаир со временем и получил эту фамилию — без изменений в основе, но с привычным для русского языка окончанием.