Фамилия Бекетская или Бекетский принадлежит к типичной модели русских фамилий на -ский, которые в большинстве своем указывают на географическое происхождение или принадлежность к местности. В данном случае основа «Бекет» могла быть либо прозвищем, либо названием населенного пункта.

Самая вероятная версия — происхождение от прозвища Бекет. В тюркских языках слово «бекет» (варианты: бекет, бикет) означало «сторожевой пост», «пикет», «караул». В русской истории XVI–XVII веков бекетами называли сторожевые отряды или укрепленные пункты на южных границах, где несли службу казаки и служилые люди. Прозвище Бекет мог получить человек, связанный с такой службой — сторож, караульный, или тот, кто жил при бекете. В пользу тюркского корня говорит и активное взаимодействие русского населения с тюркскими народами в приграничных зонах.

Суффикс -ский в фамилии Бекетский указывает на то, что она формировалась по модели, характерной для дворянских и шляхетских фамилий, а также для фамилий, образованных от названий сел и городов. Если бы фамилия произошла от прозвища напрямую, она могла бы иметь вид Бекетов (с суффиксом -ов). Вариант на -ский подсказывает, что предок мог получить фамилию по названию своего поместья или места жительства — деревни Бекетово, Бекетовка или Бекеты. Такие топонимы встречаются в Поволжье, на Урале и в Сибири — регионах, где в XVII–XVIII веках активно селились служилые люди и казаки, нередко выходцы из тюркской среды или перенявшие тюркские прозвища.

Редкая альтернативная версия связывает фамилию с именем Бекет — уменьшительной формой крестильного имени Венедикт (в просторечии Бенедикт). Однако эта гипотеза менее убедительна: от Венедикта в русской традиции чаще образовывались фамилии Венедиктов, Бенедиктов, а форма Бекет как сокращение встречается крайне редко.

В сословном отношении носители фамилии Бекетский могли принадлежать к разным слоям. Встречаются как дворянские роды Бекетских (например, внесенные в родословные книги), так и крестьянские или казачьи семьи. Географически фамилия чаще всего фиксируется в центральных и южных губерниях России, а также на Урале. Ономастический словарь Б. Унбегауна не выделяет Бекетских в отдельную статью, но модель на -ский от тюркской основы хорошо вписывается в общую картину русских фамилий, образованных от прозвищ служилых людей.