Фамилия Бекинтаев отчетливо делится на три части: корень «Бекинта-» и фамильный суффикс «-ев». Такое окончание указывает на русскую модель образования фамилий, но сама основа явно тюркского происхождения. Перед нами типичный случай, когда фамилия возникла у представителя тюркского народа, но оформилась по русскому образцу — через добавление патронимического суффикса, означающего «чей?», «сын кого?».

В основе лежит имя Бекинтай, которое состоит из двух компонентов. Первая часть — «бек» (в разных диалектах «бий», «бей»), что в тюркской традиции означает «господин», «князь», «военачальник». Вторая часть — «тай», распространенный аффикс, который в тюркских языках часто служит ласкательным или уменьшительным суффиксом при именах, а также может указывать на жеребенка (тай — «жеребенок»). Таким образом, Бекинтай — это «маленький бек», «князек» или ласковое обращение к человеку знатного происхождения.

Вероятнее всего, фамилия Бекинтаев имеет казахские или киргизские корни. В казахской ономастике имена с компонентом «бек» и суффиксом «-тай» очень распространены. Имя Бекинтай могло быть дано ребенку в знак уважения к роду или как пожелание будущего благородства. Первым носителем фамилии, скорее всего, был сын или потомок человека по имени Бекинтай — отсюда и возникла форма «Бекинтаев».

Фамилия эта встречается нечасто, что говорит о ее относительно узком ареале бытования. Носители Бекинтаевых сегодня живут в Казахстане, Киргизии, а также в России, куда фамилия попала в советский период в ходе миграций. Сословно предки Бекинтаевых могли относиться к «черной кости» (простолюдинам), но само имя-основа намекает на то, что в роду когда-то ценились воинские или управленческие традиции. Со временем именование утратило связь с реальным социальным статусом и закрепилось как фамилия, передающаяся по мужской линии.