Фамилия Беленикины — одна из тех русских фамилий, в основе которой лежит не имя, а прозвище. В её корне, скорее всего, лежит слово «белый». Но не всё так прямолинейно: суффикс -ик- в основе (Беленик-) указывает на то, что исходное прозвище было не просто прилагательным, а именем существительным — Беленика.

Как могло появиться такое прозвище? Самая простая версия — это искажённая, народная форма от слова «беленький». В живой речи, особенно в диалектах, окончания могли редуцироваться или заменяться, так что «беленький» вполне мог превратиться в «Беленика». Но есть и другая, более глубокая версия, связанная с социальным статусом. На Руси «белыми» называли крестьян, освобождённых от податей и повинностей — так называемых «обеленных». Прозвище Беленика могло закрепиться за таким вольным человеком или за его потомком, чтобы подчеркнуть их особое положение.

Сама фамилия образована по стандартной модели: к основе прозвища Беленик- добавился патронимический суффикс -ин, означающий «чей?» — то есть «сын Беленики». Со временем форма закрепилась как Беленикины.

Географически фамилия редкая. Очаги её бытования, судя по разрозненным данным, могут указывать на центральные и северные регионы России, где были распространены диалектные формы слов с суффиксом -ик- и где существовала прослойка «обеленных» крестьян. Однако точных архивных данных о месте и времени возникновения фамилии пока нет — процесс становления фамилий шёл несколько столетий, и многие локальные прозвища не попали в ранние переписи.

Что касается ударения: в фамилии Беленикины оно, скорее всего, падает на второй слог — Белени́кины. Это отличает её от похожих фамилий вроде Бе́лкины или Бе́ловы, где ударение на корне. Такой акцент — ещё одно косвенное доказательство, что в основе лежало именно полное прозвище «Беленика», а не краткое прилагательное.