Фамилия Беломесных сразу обращает на себя внимание окончанием -ых, типичным для северных и сибирских регионов России. Такая модель (на -ых/-их) чаще всего встречается в бывших владениях Новгорода, в Вятке, на Урале и в Зауралье. Она указывает на коллективную принадлежность: «из дома Беломесных», то есть из семьи, где главу или основателя рода прозвали Беломес.

Корень фамилии — прилагательное «белый» и существительное «мес» или «место». Самая вероятная версия связывает прозвище с местом жительства или работы. Беломесом могли назвать человека, жившего на «белом месте» — то есть на земле, свободной от налогов или барщины, принадлежавшей лично государю или церкви. В Московской Руси «белыми» называли земли, освобождённые от тягла, в отличие от «чёрных», податных. Прозвище Беломес мог получить крестьянин или посадский, переселённый на такой участок, или владелец «белого» двора.

Менее распространённая, но возможная версия — от слова «мес» в значении «замес» (теста или глины). Тогда Беломес — прозвище пекаря, работавшего с белой мукой, или гончара, делавшего белую посуду. Однако географическая привязка к регионам с «беломестными» слободами (например, Беломестная слобода под Тамбовом или в Сибири) делает первую гипотезу более убедительной.

Суффикс -ых закрепился в фамилии, когда в официальных документах переписчики фиксировали семью как «Беломесные», а затем форма родительного падежа множественного числа (от кого? — от Беломесных) стала наследственной. В современном написании фамилия сохраняет старую окончательную форму, не склоняясь по падежам. Она редкая, и её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких локальных гнёзд в Сибири или на Урале, где в XVII–XVIII веках селили «беломестных казаков» и крестьян.