Фамилия Беляйкина образована от прозвища Беляйка, которое могло указывать на светлый цвет лица, волос. Оно имело широкое распространение в XVI-XVII веках. Кроме того, оно могло иметь другое значение - «обеленный», то есть свободный от податей. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Беляйка, со временем получил фамилию Беляйкина.