Фамилия Бесяковы (и её мужская форма Бесяков) образована от мирского имени Бесяк — производной формы нецерковного имени Бес. Такие имена относятся к «охранительным»: родители нарекали ребёнка Бесом или Бесяком, чтобы обмануть злых духов — считалось, что носитель такого имени не заинтересует нечистую силу и останется невредимым.

В народных верованиях восточных славян бес — злой дух, постоянно вмешивающийся в жизнь людей. Он мог принимать обличье странника, кузнеца, мельника или знакомого, причинять мелкие неприятности, толкать на грех, насылать морок, заставлять плутать пьяных. Верили, что бесы соблазняют женщин, отчего рождаются уродливые дети. Имя Бес, как ни странно, не считалось богохульным — скорее, это был оберег, призванный «задобрить» или обмануть тёмные силы.

Менее вероятна версия, что основа фамилии — прозвище Бесяк, которое давали озорнику, проказнику или непоседе. В этом случае фамилия описывала бы характер человека, а не выполняла обережную функцию. Обе версии возможны, но первая — с охранительным именем — более типична для русской антропонимии до XVII века.

Суффикс -ов указывает на типичную патронимическую модель: Бесяков — сын Бесяка. Фамилия закрепилась в северных и центральных губерниях России, но точное место и время её возникновения установить сложно — процесс формирования фамилий у крестьян и посадских людей растянулся на несколько столетий и завершился лишь к XIX веку.

Фамилия Бесяковы встречается редко, что неудивительно: имена с корнем бес- после христианизации Руси постепенно выходили из употребления, уступая место календарным. В современных справочниках фамилия зафиксирована, например, в Вологодской и Кировской областях — регионах, где дольше сохранялись архаичные модели именования.