Первая из них восходит к казахскому мужскому имени Бейсен - «четверг». В основу прозвища лег диалектный вариант имени — Бейсе. Так называли мальчиков, рожденных в четверг. Вторая часть фамилии образована от тюркского «бай» - «богатый, могущественный хозяин, господин, повелитель». Можно предположить, что основатель фамилии принадлежал к знатному роду, был влиятельным, состоятельным человеком.