Фамилия Бейсетаев — одна из тех, где корень говорит сам за себя, а суффикс указывает на конкретную национальную традицию. Это фамилия казахского происхождения, образованная по русской модели с суффиксом -ев. В казахском языке фамилии часто строятся от имени отца или предка, прибавляя к основе -ов/-ев, реже -ин. В данном случае основа — мужское имя Бейсет.

Имя Бейсет, в свою очередь, составное. Первая часть — «бей» (от тюркского «бий», «бек») — означает «господин», «князь», «вождь». Вторая часть — «сет» — восходит к арабскому «Саид» (счастливый, удачливый) или к имени Сет (библейское имя, данное вместо убитого Авеля). Таким образом, Бейсет можно перевести как «господин Саид» или «счастливый правитель». В казахской ономастике имя Бейсет встречается нередко, особенно среди родов Старшего и Среднего жузов.

Фамилия Бейсетаев фиксируется преимущественно в южных и юго-восточных регионах Казахстана, а также среди казахов, переселившихся в Россию (Оренбургская, Астраханская области). Встречаемость в республике невысокая — фамилия не входит в число массовых, что типично для патронимов, образованных от конкретного, не самого распространённого имени.

С точки зрения словообразовательной модели: корень Бейсет- + суффикс -ев. Такая форма — прямое заимствование русского фамильного форманта, которое в XIX — начале XX века активно накладывали на казахские имена при записи в метрические книги и ревизские сказки. До этого у казахов не было наследственных фамилий — использовали отчества (Бейсетұлы — «сын Бейсета») или родовые имена.

Споров о происхождении практически нет: имя Бейсет хорошо документировано в тюрко-арабской лексике, а суффикс -ев однозначно указывает на русскую канцелярскую традицию оформления фамилий для инородцев. Альтернативная версия — связь с арабским «басат» (простота, легкость) — маловероятна, так как в казахском языке ударение и произношение твёрдо закрепились за формой Бейсет.

Носители фамилии — потомки человека по имени Бейсет, который, судя по значению имени, мог быть уважаемым в своей общине человеком: аксакалом, баем или военным предводителем. Никаких сведений о древнем дворянском или княжеском титуле у этой фамилии нет — она бытовая, патронимическая, как и тысячи других казахских фамилий на -ев.