Фамилия Безкишкин — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка было насмешливым или ироничным. В ней слышен отказ от чего-то привычного: «без кишки». Чтобы понять, кого так могли прозвать, придётся разобраться, что значило слово «кишка» в старом русском языке и диалектах.

Самое прямое значение — часть пищеварительного тракта. Но в народной речи «кишкой» называли не только внутренность, но и худого, тощего человека. «Кишка кишкой» — говорили о долговязом или измождённом. Прозвище Безкишка могли дать либо очень слабому, либо, наоборот, тому, кто отличался полнотой, как бы «без кишки» в смысле отсутствия живота. Вторая версия встречается реже, но исключать её нельзя.

По словообразовательной модели фамилия типична для русского севера и центральных областей: суффикс -ин указывает на принадлежность к роду. Безкишкин — сын Безкишки. Такая модель активна в новгородских и вятских землях, где прозвища на -а (-я) были особенно распространены. В южных и западнорусских говорах фамилия скорее приняла бы форму Безкишков.

В ономастических справочниках фамилия не фиксируется как широко известная. Это редкий антропоним, который мог возникнуть в среде крестьян или посадских людей. Дворянских родов с такой фамилией не известно — слишком прозрачна насмешливая основа. Сравните с фамилиями Безруков, Безносов, Беззубов: все они образованы от прозвищ, подчёркивающих физическую особенность или её отсутствие, и все бытовали в непривилегированных сословиях.

Встречаются варианты написания: Безкишкин и Безкишкин (с ударением на второй слог). В дореволюционных метриках можно найти форму Безкишкинъ, но без буквы «ё» — её в фамилии не было. Сегодня носители живут в основном в центральной России и на Урале, что подтверждает северное происхождение модели.

Если коротко: Безкишкин — фамилия-характеристика. Предок получил прозвище за худобу или, реже, за дородность. Сословно — почти наверняка крестьянский род, без титулов и громких страниц в истории, но с живым языковым следом, который сохранился до наших дней.