Фамилия Безкишкий — редкий пример того, как отрицание «без-» превращает прозвище в фамилию, указывающую на отсутствие чего-либо. Основа здесь — «кишка». В русских говорах слово «кишка» имело не только анатомическое значение, но и переносное: так называли тощего, худого человека, либо, напротив, ненасытного, прожорливого (ср. «кишка тонка», «кишка лопнет»). Прозвище Безкишка могли дать либо очень худому человеку, у которого «кишок не видно», либо, по народной иронии, тому, кто вечно голоден — «без кишки», то есть без утробы, которая бы насыщалась.

Фамилия образована по продуктивной модели: основа «безкишк-» плюс суффикс -ий (-ский). Суффикс -ский в русских фамилиях чаще указывал на дворянское или шляхетское происхождение, но в данном случае он, вероятно, добавился на стадии оформления фамилии у крестьян или мещан, под влиянием моды на фамилии с -ский. Встречаются варианты написания: Безкишский, Безкишев, Безкишкин — последние два образованы через суффиксы принадлежности (-ов/-ев, -ин) и более типичны для центральной России.

Географически фамилия Безкишкий тяготеет к западнорусским и украинским землям, где суффикс -ский особенно распространён. В дореволюционных переписях и метрических книгах она фиксируется единично, что говорит о её локальном бытовании — вероятно, в одном-двух сёлах или местечках. В современной России фамилия остаётся крайне редкой, что делает её своеобразным маркером для носителя: по ней можно попытаться восстановить конкретную родословную линию.

Интересно, что в отличие от более частых «отрицательных» фамилий (Безруков, Безногий), Безкишкий не связан с физическим недостатком, а скорее с бытовым прозвищем, основанным на шутке или насмешке. Такой тип прозвищ — «от противного» — был характерен для деревенской среды, где меткое слово могло закрепиться за целым родом.