Фамилия Бикенев — редкий случай, когда географию и происхождение можно проследить почти без споров. Основа здесь — тюркское мужское имя Бикен. Это краткая форма от более полных имён с компонентом «бик» — «крепкий, сильный, могучий» (древнетюркское *bäk). В татарской и башкирской среде такие имена были распространены: Бикбулат, Бикмухамет, Бикбай. Бикен — уменьшительно-ласкательный вариант, буквально «крепенький» или «силачок». Русский патронимический суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягкого согласного) превратил имя отца в фамилию сына: «чей? — Бикенев».

Главная зацепка для этимолога — суффикс -ев, а не -ин. Если бы фамилия образовалась от имени Бикеня (с окончанием -я), мы бы получили Бикенин. Но -ев указывает на основу, оканчивающуюся на согласный или «е»: Бикен → Бикенев. Это типично для русских фамилий, записанных от тюркских имён в XVI–XVII веках, когда служилые татары и башкиры переходили в русское подданство и их детей вносили в документы с отчеством на русский лад.

Прозвищная версия маловероятна. Хотя в некоторых говорах «бикень» могло означать что-то вроде «упрямец» или «бычок» (от тюркского «бүкән» — пень, колода), для фамилии это слишком редкое значение. Основная масса Бикеневых — потомки человека по имени Бикен. Сословно фамилия неэлитная: Бикеневы не встречаются в столбовых дворянских родословных книгах. Чаще всего это крестьяне или однодворцы из южных уездов России — Оренбургской, Уфимской, Самарской губерний, где плотно жили тюркские народы.

Написание устойчивое, без вариантов вроде Бикенёв или Бикинев. В дореволюционных метрических книгах иногда писали Бикеневъ, но корень не менялся. Сегодня фамилия остаётся редкой — по открытым данным, её носят не более нескольких сотен человек, в основном в Башкортостане, Татарстане и Челябинской области.