Фамилия Биккинеев, как и многие русские фамилии тюркского происхождения, восходит к личному имени-пожеланию. Вспомните знаменитые примеры: Тургенев — от тюркского «турген» (быстрый), Аксаков — от «аксак» (хромой), Булгаков — от «булгак» (беспокойный). В этом же ряду стоит и Биккинеев. Её основа — древнетюркско-татарское имя Биккина (или Биккиней), которое буквально переводится как «пусть ребенок непременно станет беком (князем)». Имя было популярно у татар: родители, давая его сыну, закладывали пожелание богатства и могущества, словно предрекая ему княжескую долю.

Суффикс -ев указывает на русскую модель образования фамилий от иноязычных основ, часто означая принадлежность к роду: «сын Биккинея». Поскольку имя Биккина — тюркское, его носители традиционно были мусульманами, и фамилия закрепилась в татарской и башкирской среде.

Исторические документы подтверждают бытование фамилии в Поволжье и Казахстане. В Книге памяти Ульяновской области упоминается мулла Кияметдин Биккинеев, родившийся в 1855 году в селе Сантимир Новомалыклинского района. Другой носитель — татарин Роман Абдулаевич Биккинеев, 1913 года рождения, уроженец села Подстепное Теректинского района Западно-Казахстанской области (данные из Сведений ДКНБ РК по Кызылординской области). Оба примера показывают, что фамилия была распространена среди духовенства и крестьянства, но её корень неизменно напоминает о высоком статусе, который желали предкам.