Фамилия Биккужин — классический пример русской фамилии, образованной от восточного имени с помощью патронимического суффикса -ин. В основе лежит мужское личное имя Биккужа, которое в прошлом было распространено среди башкир и татар. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «сын Биккужи», что и дало фамилию Биккужин.

Имя Биккужа составное, и его разбор сразу проясняет, чего желали ребёнку родители. Первая часть — «бик» (варианты: бек, бий), древнетюркский военный термин, который со временем стал титулом. Он переводится как «князь, господин, повелитель». Вторая часть — «кужа» — это башкирская и персидская форма иранского имени Ходжа, означающего «наставник», «хозяин». Складываясь, имя Биккужа буквально значило «господин-наставник» или «знатный хозяин». Родители, называя так сына, желали ему стать уважаемым, властным человеком, обладающим влиянием и авторитетом.

Модель образования фамилии — «имя + -ин» — характерна для русских фамилий, возникших в среде крещёных татар и башкир. Фамилия Биккужин закрепилась в документах, когда сыновей и внуков человека по имени Биккужа стали записывать как Биккужиных. Географически фамилия чаще всего встречается в Башкортостане и в соседних регионах с тюркским населением — в Оренбургской, Челябинской областях и в Татарстане.

Стоит обратить внимание на ударение: в самой фамилии оно падает на второй слог — Бикку́жин. Это отличает её от некоторых однокоренных фамилий вроде Бикку́лов (где основа другая). Поскольку имя Биккужа сегодня практически не встречается как личное, фамилия остаётся прямым и редким свидетельством этого древнего составного имени с сильной социальной окраской.