Фамилия Биккужин образована от восточного мужского имени Биккужа, которое, в свою очередь, является составным и восходит к двум компонентам: «бик» и «кужа». Слово «бик» в переводе с древнетюркского на русский язык «князь, повелитель, начальник, руководитель, глава, хозяин, господин». Именование «бик», «бек» изначально употреблялось как древнетюркский военный термин, но с течением времени оно стало активно использоваться при образовании составных тюркских имен. Кужа – это башкирский и персидский вариант иранского имени Ходжа, имеющего значение «наставник». Вероятно, нарекая ребенка именем Биккужа, родители желали, чтобы в будущем их сын стал властным, знатным господином. Таким образом, потомок человека, которого звали Биккужей, со временем получил фамилию Биккужин.