Фамилия Бисекова — женская форма фамилии Бисеков. Её основа — мужское личное имя Бисек. Как и многие восточные имена, оно составное: первая часть Би — фонетический вариант тюркского «бек» (князь, повелитель, господин), вторая — Сек. Происхождение второго компонента спорно. Наиболее вероятно, что он восходит к персидскому слову «сек» — «собака». В тюркской и персидской антропонимике имена с таким значением не были редкостью: собака считалась верным и выносливым животным, и имя могло даваться как оберег, чтобы отвести от ребёнка злые силы. Таким образом, имя Бисек можно перевести как «князь-собака» или «господин-пёс» — необычное для русского уха сочетание, но вполне объяснимое в контексте древних верований.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе имени Бисек добавили патронимический суффикс -ов (чей? — Бисеков), а затем — окончание женского рода -а. То есть Бисекова — буквально «дочь (или жена) Бисека».

Фамилия встречается в документах, связанных с Казахстаном. В Книге памяти Актюбинской области упомянут колхозник Бисеков Имаш, 1886 года рождения, из Джурунского района. Это указывает, что фамилия бытовала среди казахов и, вероятно, других тюркских народов региона. Корень «бек» в фамилии говорит о том, что предки носителей могли принадлежать к знатному или военному сословию, хотя со временем фамилия распространилась и среди крестьян.

Словообразовательная модель здесь простая, но сам состав имени показывает смешение тюркского титула и персидской лексики — типичная черта для Средней Азии, где веками пересекались разные языковые и культурные традиции.