Фамилия Бобоедов — один из тех редких случаев, когда прозвище сохранило прямую и прозрачную внутреннюю форму. В её основе лежит сложение двух корней: «боб-» и «-ед-», то есть «едок бобов». Прозвище Бобоед давали не просто любителю этого растения, а человеку, для которого бобы были заметной частью рациона или даже отличительной чертой.

Слово «боб» в славянских языках имело не только пищевое, но и символическое значение. У восточных сербов существовал обычай: невеста брала с собой столько бобов, сколько лет не хотела иметь детей, а по прошествии срока сеяла их и съедала выросшие плоды, чтобы забеременеть. Выражение «наесться бобов, гороха», известное карпатским украинцам, русским и полякам, означало то же самое — «забеременеть». Поэтому прозвище Бобоед могло относиться и к человеку, с которым связывали такие поверья, или к многодетному отцу, чья плодовитость ассоциировалась с бобами.

Фамилия образована по стандартной модели на -ов: от прозвища Бобоед через притяжательное прилагательное «Бобоедов сын» к фамилии Бобоедов. Суффикс -ов указывает на принадлежность к роду, а сама фамилия — на то, что предок носителя был известен именно под этим прозвищем.

Однокоренных фамилий у Бобоедовых немного: это Бобоедовы, Бобоедовский (если основа перешла в другую модель), а также более простые Бобов, Бобин, Бобков. Но ни одна из них не сохраняет такой яркой глагольной основы, как Бобоедов. Фамилия встречается в основном в центральных и южных регионах России, хотя точная география её бытования пока не описана в открытых ономастических источниках.

Процесс закрепления прозвища в качестве фамилии мог проходить в разных местах независимо, поэтому окончательно говорить о времени и месте возникновения фамилии Бобоедов можно только на основании серьёзных генеалогических исследований. Но сама основа — прозвище Бобоед — несомненно, памятник живой народной речи, где прозвище могло быть и шутливым, и уважительным, и магическим одновременно.