Фамилия Богаутдинова образована от мужского арабского имени Богаутдин (Бахаутдин), состоящего из двух частей. Первая из них ведёт своё начало от арабского слова «баха» - «благодать», а вторая - «дин» - переводится на русский язык как «религия, вера». Таким образом имя Богаутдин, а следовательно и фамилия Богаутдинова в буквальном смысле означает «сияние религии». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Богаутдиновых можно лишь на основании генеалогических исследований.