Фамилия Богдонас — редкий для России случай, когда литовская фамилия сохранила архаичную форму имени, которое в русском языке давно обрусело. Это не славянская фамилия с суффиксом -ов или -ин, а литовская, и её разбор показывает, как балтийские языки передавали те же христианские имена, что и восточные славяне, но по-своему.

Основа фамилии — личное имя Богдонас. В литовском языке это полная форма имени, соответствующего русскому Богдан. Если русский Богдан — это калька с греческого Феодот («данный Богом»), то литовский Богдонас — прямое заимствование из славянских языков, адаптированное под литовскую грамматику. Окончание -ас — типичный литовский номинатив (именительный падеж) для мужских имён. Таким образом, фамилия буквально означает «сын Богдонаса» или просто «Богдонас», то есть образована без дополнительного суффикса, что характерно для многих литовских фамилий.

Искать географию этой фамилии стоит не в центральной России, а на северо-западе — в Литве и в прилегающих районах Беларуси и Калининградской области. Исторически литовские крестьяне и мелкая шляхта часто носили такие патронимические фамилии без родового суффикса. В XIX веке, после отмены крепостного права в Российской империи, многие литовцы получили фамилии именно в такой форме — как прозвища или отчества, зафиксированные документально.

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна: корень Богдон- (от славянского «Богдан») плюс литовское окончание -ас. Никаких загадочных суффиксов нет. Спорных версий две: первая — что фамилия могла возникнуть как прозвище человека, который был назван в честь святого Феодота, но в быту использовалась народная форма. Вторая — что это не патроним, а топонимическая фамилия от названия хутора Богдонишки (такие названия встречаются в Литве). Вторая версия менее вероятна, так как суффикс -ас не характерен для топонимических фамилий литовцев, которые чаще заканчивались на -скис или -ишкис.

Социальный контекст прост: предки носителя фамилии Богдонас с высокой вероятностью были крестьянами или мелкими землевладельцами на территории бывшего Великого княжества Литовского. Фамилия не указывает на знатное происхождение, но чётко фиксирует этническое и языковое происхождение — литовское, с влиянием восточнославянской культуры, откуда и было заимствовано имя Богдан.