Фамилия Бокшанский — редкий пример, где топонимическая основа, скорее всего, напрямую связана с конкретным местом, но само это место неочевидно. Суффикс -ский указывает на происхождение от географического названия: такую фамилию обычно получал человек, владевший землёй или переселившийся из села или города с корнем «Бокшан-». В польской и западнорусской ономастике фамилии на -ский исторически были принадлежностью шляхты или землевладельцев, но в XIX веке их массово получали и выходцы из духовенства, и крестьяне, записанные по месту рождения.

Корень «Бокшан-» не имеет общеславянского прозрачного значения. Самая вероятная версия — происхождение от названия населённого пункта Бокшаны или Бокшан. Такие топонимы встречаются в Молдавии, на Западной Украине (например, село Бокшаны в Житомирской области) и в Румынии (город Бокша, рум. Bocșa). В этом случае фамилия указывает на выходца из этих мест. Менее распространённая гипотеза — связь с румынским словом bocșa («кузница», «горн»), что могло быть прозвищем кузнеца или владельца рудника, которое затем трансформировалось в название села, а оттуда — в фамилию.

Спорный момент — возможная связь с тюркским или венгерским источником. В венгерском языке есть слово boks («бокс» или «удар»), но оно не даёт устойчивой антропонимической модели. В тюркских языках корень «бокш-» мог означать «завершать» или «сгибать», однако для фамилии Бокшанский это выглядит натяжкой: такие основы обычно дают простые фамилии на -ов, а не на -ский. Поэтому версия с конкретным топонимом — самая надёжная.

С точки зрения социальной истории, Бокшанские — типичная фамилия западнорусских и польских окраин, где смешались славянские, румынские и венгерские влияния. Если предки носили её до отмены крепостного права, они с высокой вероятностью были либо мелкой шляхтой (однодворцами) в юго-западных губерниях, либо мещанами из местечек вроде Бокшан. Встречаемость фамилии остаётся низкой, что подтверждает её узкую локальную привязку: большинство Бокшанских и сегодня можно найти на Украине, в Молдавии и среди потомков эмигрантов первой волны в Аргентине и Франции.