Фамилия Болдакова — женская форма фамилии Болдаков. В её основе лежит прозвище Болдак, которое, в свою очередь, восходит к диалектному слову «болда». В народных говорах у этого слова был широкий разброс значений: от «большой молот, кувалда, кулак» и «трамбовка, ручная баба» до «шишка, нарост, большая блона». Это прозвище могло закрепиться за человеком по роду занятий — например, за мастеровым, который работал с таким инструментом, как болда (кузнец, плотник или строитель, трамбовавший землю).

Однако в традиции русских прозвищ нередко встречается и другая мотивация: родители могли назвать сына Болдаком в качестве охранительного имени. Вкладывая в прозвище надежду на то, что ребёнок вырастет крепким, здоровым и ладным, они давали ему имя, созвучное с понятием силы и основательности. Со временем прозвище Болдак перешло в разряд фамилий: сначала в форме Болдаков (для мужчин), а затем и Болдакова (для женщин).

Фамилия Болдакова не относится к самым распространённым, но имеет давнюю историю. Встречается она преимущественно в центральных и северных регионах России, где диалектное слово «болда» было в ходу. Примечательно, что фамилия сохранила редкую словообразовательную модель: не от имени Болдан или Болд, а именно от прозвища с суффиксом -ак, что роднит её с такими фамилиями, как Толмаков или Шушаков.