Фамилия Болобонина — женская форма фамилии Болобонин, и её происхождение напрямую связано с прозвищем, которое дали предку-мужчине. В основе лежит слово «болобон» — так в русских говорах, особенно в южных и западных регионах, называли болтуна, пустомелю или человека, который говорит много и не по делу. Сравните с однокоренными «болоболить» (болтать вздор) и диалектным «болобон» в значении «колокольчик» или «погремушка» — образ болтливого человека здесь метафорически связан с пустым, звенящим звуком.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»). Болобонин — буквально «сын или потомок Болобона». Такие фамилии от прозвищ широко бытовали в крестьянской среде, где прозвище закреплялось за родом и переходило по наследству, нередко вытесняя исходное личное имя. В данном случае фамилия не имеет отношения к дворянским родам и не связана с географическими названиями — это чисто бытовая, народная ономастика.

Интересно, что фамилия Болобонин встречается преимущественно в центральных и южных областях России: в Воронежской, Тамбовской, Рязанской губерниях. Это подтверждает её диалектную природу: именно в этих местах слово «болобон» было в ходу. Встречаются и варианты написания с одной «н» — Болобонин, но форма с двойной «н» (Болобонин) более редкая и, возможно, возникла под влиянием других фамилий на -инин.

Споров о корне почти нет: этимология прозрачна. Единственная альтернативная версия — связь с тюркским «балбан» (силач, богатырь), но она маловероятна, так как не объясняет ни суффикса, ни географии фамилии. Болобонины — это потомки человека, которого в деревне прозвали за привычку много говорить, и фамилия закрепилась за его семьёй без изменений.