Фамилия Болофинов — редкая и с неочевидной этимологией. На первый взгляд, в ней угадывается основа «болофин», но что она означает — вопрос. Самая вероятная версия связывает её с диалектным словом «болофин» или «болафин» — так в некоторых говорах называли человека с большими, навыкате глазами, либо просто «пучеглазого». Корень здесь, возможно, восходит к «боло» (от «болеть», «боль») или к чему-то, связанному с округлой формой, но внятного литературного аналога у этого слова нет. Это типичное прозвище по внешнему признаку, какими в русской среде награждали часто и охотно.

Суффикс -ов указывает на стандартную патронимическую модель: Болофинов — «сын Болофина». То есть сначала прозвище Болофин закрепилось за конкретным человеком, а затем его дети и внуки стали писаться как Болофиновы. Фамилия образована по той же схеме, что и, скажем, Глазатов или Лобанов, но с более редкой исходной формой. Встречаемость её крайне низкая, и в исторических документах она почти не фиксируется, что говорит либо о локальном бытовании в одной местности, либо о позднем письменном оформлении.

Менее правдоподобная, но допустимая версия — связь с искажённым или адаптированным иноязычным именем. Например, от тюркского «бол» (будь) и «офин» (неясно) или от греческого «Волофин» (гипотетически), но убедительных лингвистических параллелей нет. Скорее всего, перед нами исконно русское прозвище, которое со временем потеряло связь с исходным словом, и теперь его значение восстанавливается только через диалектологию и аналогии.

Носители фамилии Болофинов, если судить по скудным данным переписей, встречаются в центральных и северных областях России. Кем были предки — сказать сложно, но прозвище указывает не на профессию, а на внешность, так что родоначальник мог быть кем угодно: крестьянином, ремесленником или служилым человеком. Фамилия не дворянская и не купеческая — скорее всего, крестьянская или мещанская, что типично для прозвищ, перешедших в фамилии без привязки к сословной элите.