Фамилия Бонифат — редкая в русском контексте и почти наверняка нерусская по происхождению. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий, которые образуются через суффиксы -ов, -ев, -ин или -ский, здесь нет привычного форманта. Основа Бонифат — это готовая, застывшая форма, что сразу указывает на её западноевропейские или церковные корни.

Скорее всего, в основе лежит латинское имя Bonifatius, которое в переводе означает «благая судьба» или «делающий добро». Это имя было широко известно благодаря святому Бонифацию, просветителю Германии VIII века. В разных языках имя адаптировалось по-своему: во французском — Бонифа́с (Boniface), в итальянском — Бонифачо, в немецком — Бонифациус. Форма Бонифат могла возникнуть как усечённый вариант либо как результат народной этимологии в среде, где имя передавалось устно.

Второй возможный путь — фамилия могла произойти от прозвища, данного человеку, который служил в церкви или при монастыре, названном в честь святого Бонифация. В католических регионах Польши, Украины или Беларуси такое прозвище могло закрепиться за выходцем из прихода или за самим священником. Однако в православной традиции имя Бонифатий встречается редко, поэтому носители фамилии в России — это, скорее всего, потомки обрусевших поляков, немцев или представителей других конфессий.

Что касается суффикса, то его отсутствие — и есть главная особенность. Фамилия Бонифат относится к типу «чистых» основ, которые не переоформлялись под русскую грамматику. В русском языке такие фамилии не склоняются, если принадлежат мужчине, и всегда остаются неизменными у женщин. Это один из признаков позднего фиксирования фамилии, когда носители уже не встраивали её в систему русских патронимических окончаний.

Социальный контекст фамилии — скорее мещанский или духовный. В дворянской среде такие «голые» иностранные фамилии встречались редко, чаще их русифицировали. А вот среди городского населения, ремесленников или мелких чиновников западных губерний Российской империи форма без суффикса могла сохраниться. Географически фамилия могла бытовать на территории современной Беларуси, западной Украины или в Прибалтике, но точных статистических данных по распространению в открытых источниках нет.

Таким образом, если ваши предки носили фамилию Бонифат, можно с высокой долей вероятности предположить, что родоначальник был либо католиком, либо выходцем из немецких или польских земель, а сама фамилия связана с именем святого, а не с профессией или прозвищем по характеру.