В основе фамилии Ботагарин лежит личное прозвище – особое именование, которое подчеркивало индивидуальность предка. Фамилия Ботагарин образована от прозвища Ботагара, которое восходит к нарицательному «ботагары». В переводе с киргизского языка это слово означает «мягкая прокладка под путами ловчей птицы». Исходя из этого, можно предположить, что родоначальник Ботагариных занимался изготовлением снастей для охоты. По другой версии, основой для прозвища Ботагара послужил топоним Ботагара. Так называется поселения в Тельманском районе Карагандинской области. Так и прозвище Ботагара закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования. Таким образом, потомок человека, которого звали Ботагара, со временем получил фамилию Ботагарин. Так, наличие в фамилии Ботагарин окончания принадлежности -ин, указывает на то, что она сформировалась под славянским влиянием. Безусловно, фамилия Ботагарин представляет собой замечательный памятник восточной культуры. Однако процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности, поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Ботагарин можно лишь на основании серьезных генеалогических исследований.