Фамилия Ботусов — типичный пример того, как прозвище или мирское имя превратилось в родовое именование. В её основе лежит слово «ботус» — так в некоторых русских говорах называли толстого, неповоротливого человека или увальня. Встречается и другая версия: «ботус» могло быть диалектным названием растения или плода, например, ботвы или тыквы, что тоже могло стать прозвищем.

По словообразовательной модели фамилия относится к патронимическим на -ов: суффикс указывает на принадлежность («чей?» — сын Ботуса). Такую же модель мы видим у тысяч русских фамилий — от Иванов до Кузнецов. В ономастике восточных, западных и южных славян такие именования широко представлены. Славянские фамилии возникали от личного прозвища или от имени (христианского или языческого), и Ботусов — не исключение.

Интересно, что фамилия редкая: она почти не встречается в центральных областях России, но её следы можно найти в северных и северо-западных регионах, где диалектное слово «ботус» было в ходу. В письменных источниках XVII–XVIII веков могли фиксировать прозвище Ботус у крестьян или посадских людей, а их потомки уже получали фамилию по отцу.

Двойников у фамилии немного: однокоренные Ботов, Боткин или Ботвин образованы от других основ, хотя и звучат похоже. Ботусов стоит особняком — это не уменьшительная форма и не вариант от «ботать» (стучать, бить), а именно прозвище по внешности или характеру.