Фамилия Ботуз — одна из тех, где значение приходится восстанавливать по обрывкам диалектных слов и звуковым переходам. Единого мнения о её происхождении нет, но можно выделить две основные версии, и обе упираются в прозвище, которое дали родоначальнику.

Первая версия связывает прозвище Ботуз с глаголом «бутузить» — колотить, бить кулаками. Если так, то прозвище получил драчун, задира или человек, который решал споры силой. Вторая версия выводит Ботуза из слова «бутус». В старину бутусом называли приземистого, плотного, коренастого человека. В новгородских и пермских говорах у этого слова был другой оттенок — упрямец или угрюмый мужчина. В таком случае прозвище могло указывать на особенности внешности (невысокий, крепкий) или характера (несговорчивый, хмурый) основателя рода.

Менее распространённая гипотеза относит Ботуза к «профессиональным» прозвищам: якобы так могли называть строителя или лесоруба. Однако эта версия слабее — прямой связи со строительным делом или рубкой леса в корне слова не прослеживается, и лингвистических подтверждений ей меньше.

Чередование гласных о/у (Ботуз / Бутуз) и согласных с/з — результат исторических фонетических процессов, которые происходили в живой речи. Поэтому фамилия могла закрепиться в форме Ботуз, хотя исходное слово звучало как «бутуз» или «бутус». По сути, это вариант одной и той же основы, который со временем стал самостоятельной фамилией.

Фамилия образована без типичного суффикса (-ов, -ин, -ский), то есть перешла в наследство прямо из прозвища. Такие «чистые» фамилии без оформления — редкая модель, чаще встречающаяся на западе и юге России, а также в среде казачества. По этой примете можно предположить, что корни рода Ботуз — не в центральных областях, а в диалектных зонах, где прозвища охотнее переходили в фамилии без изменений.

Точных сведений о сословной принадлежности или географии фамилии в открытых источниках мало. Можно сказать лишь, что прозвище Ботуз (или Бутуз) было распространено в крестьянской и мещанской среде, где меткие бытовые характеристики закреплялись за целыми семьями.