Фамилия Брагинцева образована от прозвища Брагинец. Оно ведет свое начало от нарицательного «брага» - «старинный русский слабоалкогольный напиток», «хлебный напиток, иногда более похожий на квас». Очевидно, прозвище относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на деятельность основателя фамилии: он мог быть винокуром, либо торговцем брагой. Согласно другой гипотезе, фамилия Брагинцева восходит к топониму Брагино. Не исключено, что предок был уроженцем или жителем одного из них. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Брагинец, со временем получил фамилию Брагинцева.